《神秘博士第四季》中，博士与他的同伴罗斯·泰勒在经历了分离后再次重逢，共同面对宇宙中最危险的威胁。本季开篇便是紧张的“时间裂缝”事件，随后博士在“图书馆之夜”中遇见了神秘的河流·宋，她的真实身份成为后续剧情的伏笔。随着“黑暗边缘”的危机，博士被迫与终极反派Davros正面对抗，并在宇宙的尽头做出牺牲。第9集“午夜”以其心理恐怖氛围成为经典，而季终集“旅程的终点”中，博士被囚禁，罗斯触及真正的时间漩涡，为第五季埋下伏笔。本季融合了情感、动作和深刻的哲学思考，是神秘博士系列的巅峰之作。